经国家人社部、科技部、教育部、财政部、国家发展和改革委员会、国家自然科学基金委员会、中国科学技术协会七部委组织专家的评审及批准，中科院上海技术物理研究所冯旗研究员入选2009年度新世纪百千万人才工程国家级人选。

冯旗研究员主持完成了海洋一号卫星A星、海洋一号卫星B星十谱段海洋水色扫描仪和实践七号卫星多谱段相机遥感仪器的研制。其中实践七号卫星多谱段相机在33个月时间内完成了相机的研制工作，取得了首飞成功。2004年获国务院政府特殊津贴,先后荣获国家科技进步二等奖2项、中国科学院科技进步二等、三等奖各1项，上海市科学技术奖一等、二等奖各1项、国防科学技术一等奖2项。